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hudsonaDo seu script você não vai precisar setar todas as variaves de ambiente.
E o resto você provavelmente vai conseguir adaptar com o windows power shell, ou perl, ou até C.
No caso perl é o mais proximo do shell, acredito que vai ser o mais simples para se implementar isso.
Ainda existe alguns modulos na internet que fazem um compilador perl interpretar os comandos em shell.
E por último, existe também um programa que simula a estrutura do linux em tempo real no windows, não é maquina virtual, ele roda como se fosse um programa no windows, só que você tem a opção de usar alguns recursos do linux, entre elas o console, shell, awk e etc.
Faça uma pesquisa e verifique a melhor solução para você.
Abraços!!