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burgaQual a versão do banco que você está usando? Um primeiro passo, mais basicão mas que pode ajudar, se tiver usando o 10g ou versão mais recente, é você verificar os advisors do proprio EM. As vezes ele pode apontar pra algum índice faltando, etc.
Seria uma boa você olhar as diferenças entre o RBO e CBO, uma leitura fácil e boa pra começar é o oracle one-on-one do Tom Kyte (http://www.amazon.com/Expert-One-One-Oracle-Thomas/dp/1590592433).
Aqui no blog do Hudson também tem coisas interessantes em relação às diferenças entre os processamentos de JOINS <a href="https://profissionaloracle.com.br/blogs/hudson/“>HASH, MERGE, NESTED LOOPS
No blog do Regis também tem sobre a utilização de Índices (https://profissionaloracle.com.br/blogs/regisaraujo/).
Também tem bastante material sobre HINTS pela web que você pode procurar.
Se você sair fuçando no material que o pessoal disponibiliza aqui no próprio grupo, você vai encontrar várias informações legais, e a partir daí vai começar a ter uma idéia de como iniciar o tunning de uma consulta.
Abraços,